Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms