Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABPAQ06546 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABPAQ06546 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GABPAQ06546 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GABPAQ06546 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPAQ06546 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms