Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms