Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms