Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms