Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms