Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms