Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms