Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS4XP62701 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms