Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms