Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms