Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms