Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSWP56202 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSWP56202 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSWP56202 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSWP56202 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms