Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP6P55212 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP6P55212 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP6P55212 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms