Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP7P55210 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP7P55210 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP7P55210 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP7P55210 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP7P55210 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP7P55210 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP7P55210 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP7P55210 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP7P55210 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP7P55210 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP7P55210 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP7P55210 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP7P55210 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CASP7P55210 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CASP7P55210 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CASP7P55210 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CASP7P55210 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP7P55210 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP7P55210 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms