Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HADHBP55084 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHBP55084 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHBP55084 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHBP55084 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHBP55084 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHBP55084 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHBP55084 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHBP55084 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHBP55084 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHBP55084 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHBP55084 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHBP55084 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHBP55084 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHBP55084 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms