Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23BP54727 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms