Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRAP54198 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRAP54198 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIRAP54198 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIRAP54198 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIRAP54198 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms