Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HK3P52790 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HK3P52790 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HK3P52790 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HK3P52790 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HK3P52790 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HK3P52790 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms