Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORCP51449 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORCP51449 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms