Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms