Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM4P49221 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms