Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms