Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms