Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP5P45974 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP5P45974 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP5P45974 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP5P45974 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP5P45974 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP5P45974 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP5P45974 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP5P45974 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP5P45974 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP5P45974 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP5P45974 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP5P45974 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms