Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5CP41229 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5CP41229 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5CP41229 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5CP41229 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5CP41229 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5CP41229 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5CP41229 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM5CP41229 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM5CP41229 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM5CP41229 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM5CP41229 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM5CP41229 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5CP41229 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms