Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms