Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms