Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms