Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTGS2P35354 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms