Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKARP32238 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKARP32238 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms