Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms