Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM4SF1P30408 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms