Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms