Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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