Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD34P28906 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD34P28906 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms