Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCAP28676 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCAP28676 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms