Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDE4AP27815 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms