Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HRCP23327 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HRCP23327 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HRCP23327 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HRCP23327 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HRCP23327 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HRCP23327 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HRCP23327 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HRCP23327 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HRCP23327 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms