Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1BP22528 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SPRR1BP22528 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms