Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms