Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms