Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms