Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF1P18846 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF1P18846 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF1P18846 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF1P18846 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF1P18846 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF1P18846 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF1P18846 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF1P18846 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF1P18846 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms