Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms