Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB4P16144 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms