Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NME1P15531 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NME1P15531 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NME1P15531 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NME1P15531 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NME1P15531 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NME1P15531 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME1P15531 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME1P15531 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME1P15531 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms