Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms