Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms