Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms